Use o LibreOffice para abrir o arquivo e, em seguida, salve no formato desejado: Eu tive exatamente o mesmo problema que você descreveu ao tentar usar o Excel 2010 para ler dados MySQL UTF-8 com texto em várias linhas em japonês em alguns campos exportados como CSV citado com \ r \ n usado para o fim de registro (tentei e \ n também sem diferença no comportamento do Excel). O LibreOffice 4.1.3 importou o arquivo CSV corretamente, e eu poderia salvá-lo no formato xlsx do Excel 2010 e, a partir daí, abrir o arquivo xlsx corretamente no Excel.