Uma outra opção é usar um driver como o Ext2 IFS para Windows para fazer com que o Windows leia / grave o sistema de arquivos do seu Ubuntu roda em (deve ser ext2 ou ext3).
Eu usei essa abordagem com o Windows XP e o Ubuntu 8.10 & 9.04 com sucesso. Eu tinha meu perfil do Thunderbird armazenado na unidade do Ubuntu e, portanto, podia acessá-lo do Windows e do Linux da partição ext2. Com o driver, a unidade do Linux é simplesmente acessível a partir do Explorer como um disco FAT32 / NTFS.
Nunca tive problemas com isso, mas você pode querer verificar o site em busca de possíveis problemas.