Estou executando o Ubuntu 12.04 de 64 bits com uma Nvidia GeForce 8400 GS. Eu tive problemas relacionados ao Flash desde que realizei uma instalação limpa do 12.04. Assim como você, eu instalei os drivers proprietários, mas as configurações do sistema > Listas de detalhes Gráficos como "Desconhecido".
Eu estava tendo problemas de velocidade, mas o mais irritante é que os mesmos problemas relatados em vídeo em Flash aparecem em azul neste fórum. Seguindo a solução postada no link anterior, o comportamento indesejado de todos os vídeos em Flash ficou azul, mas acabou causando a falha do plug-in do Flash quase toda vez que eu tentava assistir a um vídeo on-line.
A solução para mim era olhar para o /etc/adobe/mms.cfg e remover tudo menos uma linha, que deveria ser:
OverrideGPUValidation=true
Se você não tiver certeza de como fazer isso, poderá usar seu editor de texto favorito (para mim é vi) ou poderá abrir o gedit com o seguinte comando de terminal:
sudo gedit /etc/adobe/mms.cfg
Escreva na linha OverrideGPUValidation = true acima, salve o arquivo e saia do gedit. Reinicie seu navegador e veja se isso resolve os problemas que você está tendo.
Esta ideia e outras são discutidas em ubuntuforums e em muitos outros lugares. Por favor, tente alterar o seu mms.cfg (ou criá-lo, se já não existir) e poste de volta com seus resultados. Boa sorte!