Acho pdfseparate muito conveniente para dividir intervalos em páginas individuais. Esse comando extrairia as páginas de 1 a 5 de input.pdf
nos arquivos chamados output-page1.pdf
, output-page2.pdf
, ...
pdfseparate -f 1 -l 5 input.pdf output-page%d.pdf
Se você quiser recombinhá-los em intervalos de páginas, por exemplo, de 1 a 3 em um documento e de 4 a 5 em outro, use o programa complementar, pdfunite, da seguinte forma:
pdfunite output-page1.pdf output-page2.pdf output-page3.pdf final-pages1-3.pdf
pdfunite output-page4.pdf output-page5.pdf final-pages4-5.pdf
Eu acredito que essas ferramentas são parte do poppler e podem já estar instaladas no seu sistema.