Use /usr/bin ou /usr/local/bin .
O último é normalmente usado para o software adicional que você instala, para mantê-lo separado do que o sistema fornece imediatamente e é provavelmente a escolha tecnicamente correta.
No entanto, o primeiro é mais comumente no PATH por padrão e pode, portanto, ser mais fácil de usar.
/bin é principalmente para software de sistema essencial necessário no modo de usuário único.
Veja o Padrão de hierarquia do sistema de arquivos ou seu artigo da Wikipedia para mais informações.
/opt é para pacotes de software (geralmente com muitos arquivos e sua própria hierarquia de diretórios), e um único binário dificilmente faz dele um pacote.