Você deseja que tsocks esteja procurando uma maneira de "torificar" qualquer aplicativo. Você precisa editar /etc/tsocks.conf para apontar para sua instância do Tor, e então você pode executar qualquer comando através do Tor dessa forma: tsocks nslookup yahoo.com
No Windows, um programa puro equivalente a este é o ProxyCap, mas não é gratuito.
No que diz respeito a navegar em páginas da Web, você certamente deseja encadeá-lo através do Polipo ou do Privoxy para retirar suas solicitações HTTP de saída de informações potencialmente identificadoras antes que o Tor as obtenha.