Acontece que este é um problema conhecido. A Adobe tem artigo da base de conhecimento que diz:
Known issues
Reader's Preferences > Internet > Display PDF in Browser is always dimmed
- To disable Safari integration, delete the AdobePDFViewer.plugin from /Library/Internet Plug-ins
- To reenable Safari integration, rerun the installer over the current installation. Start the Acrobat/Reader X installer from the original media, and then follow the onscreen prompts to complete the installation.
Espero que o plug-in não volte na próxima vez que o Reader for atualizado.