Não há uma maneira fácil de fazer isso automaticamente, mas o OneNote tende a se encaixar em uma grade quando você move caixas de texto manualmente; você só precisa "observá-la" quando ela está alinhada com outras caixas de texto.
Uma outra opção é habilitar as linhas de grade em sua exibição do OneNote, o que ajudará você a enxergar pelo menos: Na Faixa de Opções, vá para a guia Exibir e, na área Configuração da Página, há uma opção Linhas de Regra na qual você pode escolher uma grade a ser exibida de vários tamanhos. Você também pode verificar se suas páginas sempre foram criadas com essas linhas de grade.