Como todos os terminais lançados no gnome, ele deve herdar o ambiente PATH do processo pai. Em última análise, eles vêm dos arquivos /etc/login.defs
e /etc/environment
e são inicializados sempre que você faz login.
Na verdade, se você for para outro tty e efetuar login (Ctrl + Alt + F1), verá o mesmo caminho do terminal do gnome. Mas não o mesmo caminho limitado como elementar.
Eu pediria para você relatar um bug, mas a equipe elementar não registrou um serviço de relatório de erros.