Use a ferramenta msconfig para desativar seus processos de inicialização um por um. É claro que será mais difícil encontrar o processo porque acontece aleatoriamente ... então, minha primeira tentativa seria desabilitar todos os itens de inicialização e verificar se realmente é algum aplicativo que está causando isso. Se ainda acontecer com todos os itens de inicialização desabilitados, procure em serviços.