"Depende". Todas as outras coisas sendo iguais, a densidade do prato correlaciona-se diretamente com uma taxa de transferência sequencial aumentada.
No entanto, você precisa saber qual é a densidade do prato. Se a unidade de 400 GB tiver 2 discos de 200 GB e a unidade de 80 GB usar 1 prato curto de 200 GB, a unidade de 80 GB será mais rápida no geral (porque o tempo médio de busca será menor).
O espaço adicional na unidade pode acabar sendo útil de alguma outra forma durante a vida útil do sistema. A menos que você esteja olhando para comprar milhares de sistemas foram $ 13 / ea é um disjuntor do orçamento, eu optaria pelo disco rígido maior imediatamente. Caso contrário, se você acabar querendo ou precisando de uma unidade maior, você está olhando não apenas para as despesas das unidades em si, mas também para o tempo gasto na troca das unidades e na geração de imagens do conteúdo.
Pessoalmente, eu não instalaria uma unidade tão pequena em um novo sistema a menos que houvesse outras considerações em jogo. (por exemplo, é um SSD, sensibilidade orçamentária, etc.)