Eu encontrei exatamente o mesmo problema depois de atualizar para o El Capitan. Você deve dar uma olhada no comando "csrutil". Inicialize a partição de recuperação, inicie um terminal (no menu Utilitários) e insira o comando para ver como usá-lo. Executando "csrutil disable" e reiniciando a máquina depois corrigiu o problema para mim. Além disso, criei uma nova VM para o Bootcamp estar no lado seguro. Estou usando o VMware Fusion versão 7.1.2 Pro, o Windows 8.1 está instalado na partição do Bootcamp.
Desative a Proteção de Integridade do Sistema (Apple Developer Forum)