Desde que o BIOS suporte, não deve haver nenhum problema em particular. A seqüência de inicialização basicamente começa com o BIOS reconhecendo uma unidade mestre com um registro mestre de inicialização (MBR) onde o Windows é armazenado e, em seguida, chamando o carregador de inicialização do Windows. Como o windows tem suporte a eSATA e basicamente abstrai o hardware como letras de drive como C: ele apenas lê os arquivos do disco independente da interface de hardware