Eu não acho que copiar na mesma partição seja mais rápido. Se você quer dizer "em movimento", então veja a resposta de Daniel Schwartz, ele explica perfeitamente o que está acontecendo.
No entanto, se você quer dizer uma operação de cópia real, eu não esperaria grandes diferenças de desempenho, desde que a operação ocorra no mesmo disco. Pode haver algumas diferenças por causa do tempo, a operação de posicionamento da cabeça consumirá para discos rígidos (obviamente não para SSDs), mas eu não espero que o impacto disso seja muito grande. Talvez existam também algumas diferenças devido a diferentes estratégias de cache do sistema operacional, mas também este efeito, eu não espero ser muito grande.
O que faz uma grande diferença é copiar de um para outro disco. Se o controler for rápido, isso é muito mais rápido do que copiar no mesmo disco, porque a unidade só precisa ler ou gravar, não fazer as duas operações juntas (Uma exceção a essa regra pode ser dados pequenos, por causa da cache hdd e controlador).
Por favor, note que o sistema operacional pode fazer links para arquivos. Nesse caso, os dados não serão copiados, mas apenas uma nova referência aos dados será criada (o arquivo também não consumirá o dobro de espaço). Isso é muito rápido. Mas se você copiar seus arquivos com os comandos explorer ou shell padrão, os arquivos serão copiados e não vinculados.