Abaixo estão vários produtos anunciados como gerenciadores de janelas, que talvez valham a pena conferir, pois sua descrição inclui a alteração de ícones de janelas. (Eu não tenho experiência com nenhum deles.)
Freeware
7Conifier
< a href="http://download.cnet.com/XNeat-Windows-Manager/3000-2072_4-10448017.html"> Gerenciador do Windows do XNeat
RegToy
Comercial (ordem alfabética, ensaios disponíveis)
Gerenciador real de janelas
Estúdio Changer da Barra de Título
Transparente Gerenciador de Janelas
TweakWindow
WindowStudio