A temperatura de 90 ° C pode ser o limite para a sua GPU, onde começa a "estrangular", ou seja, pára um pouco para esfriar. Ou talvez o processador usando os mesmos heatpipes / sink atinge seu limite. Quão alta a temperatura do CPU vai? (CPU-Z) e qual modelo de CPU específico possui esse MacBook?
Coloque algo pequeno sob o laptop para aumentá-lo, dando-lhe mais espaço para respirar ou use um bloco de resfriamento ativo com ventoinhas alimentadas por USB e veja se há menos congelamentos