Isso acontece quando os caracteres de controle EOL não estão corretos. O Windows representa novas linhas com o carriage return
+ line feed
.
No Notepad ++, você pode verificar esses caracteres selecionando:
Ver > Mostrar símbolos > [x] Show End of Line
Vocêprecisamodificarseuscriptparaqueseusdadossejamformatadosassim: