Não
Não há criptografia zero aplicada por padrão a um backup do Time Machine.
Embora você possa não ser capaz de "carregar" facilmente um backup do Time Machine de outro computador, imagino que seria muito trivial alguém realmente ver os arquivos, já que nenhum esforço especial é feito para protegê-los dessa maneira. .
Edit: Como Arjan disse: "Carregá-lo é tão fácil quanto pressionar Option para alterar" Enter Time Machine "em" Browse Other Time Machine Disks "."