Sim. O Déjà-Dup é um front-end gráfico para a Duplicidade (página da Wikipedia) , um programa de backup de linha de comando. Você pode executar o Duplicity no Windows usando o Cygwin e restaurar os arquivos a partir da linha de comando.
Configurar o Duplicity no Windows pode estar um pouco envolvido. Esse cara tem algumas instruções ; você pode pular a configuração de algumas das dependências (pexpect, SSH) que são necessárias para fazer backups remotos.
Se bem me lembro, o comando para restaurar é
duplicity restore file:///path/to/backup /path/to/restore/to
Você pode acessar os arquivos restaurados nesse diretório.
Se você não estiver familiarizado com a linha de comando, será mais fácil inicializar o computador com um CD ao vivo e usar duplicity ou Déjà-Dup do Linux para restaurar os arquivos na partição do Windows.