É porque você tem :set number depois no seu .vimrc - number e relativenumber são incompatíveis entre si. Pegue essa linha.
Por toda a vida, não consigo entender por que set relativenumber não é carregado quando definido no arquivo .vimrc . Outras configurações, como set number e configuração do esquema de cores, funcionam perfeitamente. Se eu quiser set relativenumber , eu preciso configurá-lo no buffer atual explicitamente. Alguma ideia? Meu arquivo .vimrc pode ser encontrado aqui:
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Obrigado.