A resposta do usuário Zac Pullar-Strecker está correta: os EXEs são filtrados se eles residirem em um local desconhecido pelo Windows 10. Afinal, o Windows 10 é o "mais seguro do Windows".
Uma solução para esse problema é adicionar suas pastas ao ambiente PATH variável. Um utilitário útil e gratuito para editar o PATH é o System Path Commander .
Outra solução é criar atalhos para seus EXEs em alguma subpasta
do menu Iniciar. O script LnkAllToStart pode ser usado para automatizar
adicionando todos os EXEs da pasta atual para
"%APPDATA%\Microsoft\Windows\Start Menu\Programs\<your sub-folder>
.