Se você não quiser usar software comercial, tente Borracha . É grátis e de código aberto. Embora eu não tenha feito o teste, isso deve funcionar.
Mas você deve sempre estar ciente de que pode haver fragmentos do arquivo ou todo o arquivo deixado no disco, mesmo que você o tenha apagado com segurança. Muitos programas salvam cópias temporárias de arquivos abertos nas pastas temporárias, por exemplo. Então, para se livrar com segurança de seus dados, você teria que encontrar todos esses locais e excluir os arquivos nesses locais também. Para complicar o assunto, eles já poderiam ter ido embora, porque os programas normalmente excluem os arquivos quando eles saem. Mas é claro, eles usam o método de exclusão de sistemas de arquivos, então os dados em si ainda estão no disco, eles não aparecem mais nas listagens de diretórios.