Isso funcionou com o meu (Windows 7, VLC 1.1.11):
start "C:\Program Files\VLC\vlc.exe" "D:\Movies\The Italian Job.avi" --start-time 12 --stop-time 20
Basta substituir os caminhos de arquivo & segundos em conformidade. O número 12
significa que o filme começará a ser reproduzido no 12º segundo; o 20
significa que vai parar no vigésimo segundo.