Quando eu uso a ferramenta de busca no PyCharm, ele procura apenas a página que está atualmente em foco. Se a string for encontrada no arquivo atual, ela mostrará os resultados nessa página e, em seguida, o botão "Localizar tudo" será ativado. Quando clico nele, ele mostra uma árvore de diretórios de todo o projeto, produzindo apenas os resultados encontrados no arquivo original. "Localizar tudo" não encontra todas as referências no projeto.
Estou usando o PyCharm Community Edition 4.0.1.
Edite > > Encontre > > Localizar no caminho (isso pesquisará o projeto inteiro).
Destacar uma expressão e pressionar ctrl-alt-F7 também encontra todo o uso.
Atualização: Na versão que estou usando atualmente, PyCharm Community Edition 2016.2.3, o atalho é para destacar a expressão e pressionar ctrl-shift-F.
1) Editar > > Encontre > > Encontrar no caminho Certifique-se de clicar em "Escopo" para que ele pesquise em todo o projeto.