Sem recompilar o kernel e basicamente muitos problemas, não tenho idéia de como impedir que o sistema operacional escaneie um disco rígido, já que a detecção / verificação de hardware é uma das primeiras coisas a acontecer.
Eu estou supondo que você tem algum tipo de KVMoIP, e é por isso que você pode acessar o BIOS, mas não o acesso físico - eu pessoalmente perguntaria ao DC ou quem quer que fosse para desconectá-lo - no entanto, se isso não for possível, BIOS, onde você vê os discos rígidos, eles quase sempre estão configurados para detecção "Automática", se você configurá-lo para "Desativado", ele deve fazer o que quiser.
No entanto, isso depende da sua BIOS e, se não estiver lá, você pode estar sem sorte.