Desde que encontrei a resposta, sou eu quem a postou. A correção aqui é abelha. As placas da Nvidia que usam o Optimus, como a 540m, precisam ser capazes de utilizar o Optimus para funcionar corretamente. Bem, na verdade não; mas sem Optimus o computador não consegue diferenciar entre as duas placas. O Bumblebee permite suporte ao Optimus em sistemas Linux. Instale-o e o problema deixará de existir.