Se você realmente tiver um rootkit no seu bios, uma das coisas que o rootkit provavelmente faria é se recusar a permitir que quaisquer outras atualizações sejam aplicadas. Pelo menos, é o que eu faria se eu escrevesse um rootkit de bios já que, sabe, o computador tem que usar as funções do bios para atualizar a bios ...
Nesse cenário, suas únicas opções são forçar o flash configurando um jumper de reset (provavelmente uma opção em um netbook) ou arrancando o chip e soldando um novo na placa-mãe (e boa sorte com isso; você vai precisar disso).
A boa notícia é que você provavelmente não tem rootkit, e se você conseguir fazer o BIOS funcionar com um baixado do fabricante (asus) através dos meios normais que seriam confirme.