IMHO, esse é um recurso que está faltando em plataformas não-X11. :)
Se você estiver usando o KDE ou o GNOME, você deve começar a bisbilhotar os respectivos painéis de configuração do mouse.
Se isso não der certo, verifique o link Esta página lista algumas maneiras de ajustar seus arquivos de configuração do X11.
Você pode conseguir algo como:
xmodmap -e "pointer = 1 0 3 4 5"