A Microsoft tem um artigo da base de conhecimento apenas para esta situação:
KB236014 - "INFO: Extensões do Shell para nomes de arquivos sem extensão de arquivo"
Blurb:
For example, to associate a program (for example, Notepad.exe) to open all files with no extension, use the following registry keys:
[HKEY_CLASSES_ROOT\.]
@=""
[HKEY_CLASSES_ROOT\.\shell]
[HKEY_CLASSES_ROOT\.\shell\open]
[HKEY_CLASSES_ROOT\.\shell\open\command]
@="<path to notepad.exe> %1"