Eu ia escrever uma resposta dizendo que a velocidade de transferência era importante para os arquivos grandes de backup, então use o SATA-3, mas depois de olhar este documento link Não tenho certeza se a velocidade da interface vai fazer a diferença, porque é o disco rígido que é o limite.
Why Is SATA 6Gb/s Needed Now?
Today, hard drives for PCs don’t seem to be pushing the limits of the SATA 3Gb/s interface. The highest-performance desktop drives on the market deliver about 1.5Gb/s in sustained data transfer rates. Add another 0.5Gb/s in command overhead that is not available for general data transfers, and you still have 1Gb/s of headroom before you bump into the 3Gb/s ceiling. But it won’t be long before hard drive technology catches up to the SATA 2.0 standard. Seagate estimates that hard drive transfer rates will exceed 2.5Gb/s by mid-2011. Add in the 0.5Gb/s command overhead, and the SATA 2.0 standard is out of gas.
O PDF tinha a data de janeiro de 2010.
O fez uma comparação entre o SATA-2 & SATA-3 e 32 MB & 64MB, mas infelizmente, eles compararam interface lenta e menos cache para interface mais rápida e cache maior. Teria sido interessante se eles fizessem a comparação que você estava procurando.
Infelizmente, acho que olhar para os sites de hardware e obter números independentes sobre a taxa de transferência real é a única maneira verdadeira de saber.