Estou usando o FastStone Image Viewer para isso, mas também testei o XnView.
Você pode ter até quatro imagens e cada uma preencher quase um quarto da tela. Quando você aumenta ou diminui o zoom, todas as quatro imagens são ampliadas na mesma quantidade. Quando você aumenta o zoom para que a imagem seja maior que sua área de exibição, você pode clicar e arrastar uma imagem para movê-la. À medida que você se desloca, cada foto é movimentada em uníssono, facilitando a comparação dos pixels reais em cada imagem.