CompizConfig parece ter as ferramentas necessárias para três monitores. Uma visão geral incluindo a instalação pode ser encontrada aqui . Um vídeo do youtube mostrando três monitores em ação, incluindo o monitor do meio sendo exibido em tela cheia, pode ser encontrado aqui .
De acordo com o link que você já visitou e comentou em aqui você precisa iniciar o CompizConfig e selecione (CCSM- > Geral- > Configurações de exibição- > Saídas). Então, como um usuário sugeriu que aqui adicione essas saídas a ele e desmarque "Detect Outputs":
1280x1024+0+0
1280x1024+1280+0
1280x1024+2560+0
A configuração dele era de três monitores de 1280 x 1024, portanto, você precisaria ajustar suas configurações de acordo.
Infelizmente eu não tenho três monitores e minha configuração de monitor duplo funciona perfeitamente, então não tenho necessidade do CompizConfig nem posso testá-lo para o seu ambiente.