Forçar uma pasta aninhada não é possível com a interface do usuário padrão.
A única opção é mover a pasta depois de criar o backup. Toda a informação é auto - contida na pasta.
Na verdade, essa é a recomendação da Microsoft para backups em um compartilhamento de arquivos de rede. O backup só permitirá que uma imagem de backup exista por compartilhamento de arquivo. Renomear as pastas após o fato permite que você mantenha várias versões de uma imagem por compartilhamento de arquivo. Houve uma postagem no blog sobre scripts usando wbadmin
, que é a linha de comando do Backup no blog do Windows Storage há algum tempo. Isso também é o que faço com minhas máquinas.