você pode usar o recurso runas do windows.
Por exemplo, você tem 2 usuários em suas janelas, user1 e user2, user1 é o usuário com quem você trabalha.
aqui está o que você faz.
1. login to user1, install dropbox
2. login to user2, install dropbox
3. back to user1, create a bat file with the following content: runas /user:user2 C:\Users\User2\AppData\Roaming\Dropbox\bin\Dropbox.exe
4. run dropbox on user1 as usual. then run this bat file, you'll be asked to type password of user2. then you have a second dropbox!