Eu resolvi o problema há muito tempo, mas não tive tempo para escrever a resposta. Aqui está:
O Mac OS X tem uma ferramenta que pode resolver o problema de maneira decente. É chamado FileMerge e pode ser encontrado em / Developer / Application / Utilities quando você instala as ferramentas do desenvolvedor Xcode do CD do Mac OS X.
Primeiro,comparaasduaspastasselecionadase,emseguida,mostraasdiferenças.Vocêpodeentãoselecionarsedesejamesclarosarquivosemumarquivodedestino.
Paramaisinformações,leiaesteartigo:
http://www.macworld.com/article/49584/2006/03/cmpfldr.html