O Cobian suporta vários padrões de compactação comuns, mas a criptografia bloqueará você se você usar isso. Sem compressão, é essencialmente uma cópia direta, então não há bloqueio. Descobri que é muito bom para esse tipo de backup, pois você pode fazer backups com timestamp, permitindo manter facilmente várias cópias de seus dados na unidade.
Eu não posso falar por nenhum dos outros na lista, pois não os usei. O outro software com o qual trabalhei no ntbackup (um pouco limitado, mas que pode funcionar razoavelmente), e o BackupExec da Symantec - que é um enorme exagero para o que você deseja. No entanto, se você escolher, o formato será .bkf, que é compartilhado com o ntbackup. Eu também usei vários programas baseados em rsync, que são essencialmente cópias diretas, então não há bloqueio.