Redimensionar a barra de ferramentas
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Os usuários do Google Chrome podem redimensionar a área na qual as extensões podem exibir ícones passando o mouse sobre a área entre o final do campo de endereço e o início da área do ícone de extensão e usando o botão esquerdo do mouse para redimensionar a área usando arrastar e soltar.
Se as extensões de área não forem exibidas o suficiente para conter todos os ícones de extensão, as que não puderem ser exibidas serão movidas para a parte superior do menu do Google Chrome.
Você pode verificar isso facilmente clicando no ícone do menu para exibir todos os ícones de extensão que sobraram.
Ocultar extensões do Chrome
Veja isto
Não faz sentido exibir ícones de extensões que não exigem interação com o ícone. Embora você possa querer ter acesso a alguns ícones para usar a funcionalidade da extensão sempre que for necessário, interagindo com ela, algumas extensões podem exibir um ícone, mesmo que não agregue qualquer valor à funcionalidade que ela oferece.
Infelizmente, o Google implementou a funcionalidade de ocultação de uma forma que é impossível remover totalmente os ícones de extensão da interface do usuário do navegador.
Enquanto você pode clicar com o botão direito do mouse em extensões na barra de ferramentas do Google Chrome e selecionar "ocultar no menu do Chrome", isso moverá o ícone para o menu do Chrome, onde ele ainda será exibido.
Não há nenhuma opção disponível atualmente para ocultar o ícone de extensões na barra de ferramentas e no menu do Chrome.
A única opção disponível para isso seria desinstalar a extensão, mas isso também removeria sua funcionalidade
Source: http://www.ghacks.net/2016/03/03/how-to-hide-extension-icons-in-google-chrome/