Seu problema não é específico do Windows ou do Clonezilla. O que aconteceu é que o Clonezilla não copia apenas arquivos, mas copia partições como claramente indicado na página oficial do Clonezilla :
“Clonezilla is a partition and disk imaging/cloning program…”
O que aconteceu foi que quando você executou o Clonezilla entre a unidade de 120 GB e a unidade de 2 TB, o Clonezilla literalmente copiou a partição exata de 120 GB da sua unidade antiga para a nova. Isso é muito útil para fazer imagens de disco de uma unidade do mesmo tamanho exato para outra unidade do mesmo tamanho, mas - como você pode ver agora - não é tão grande ao copiar dados de uma unidade pequena para uma unidade maior.
Então, sua escolha agora é criar uma nova partição com o espaço extra na unidade de 2 TB e usá-la. Mas se eu fosse você, iria reformatar e reparticionar esse 2TB e usar um utilitário de cópia de arquivos puro. Não sou especialista em Windows, mas baseado em este PC Artigo da revista World , EaseUS Todo Backup Free 9.2 parece ser uma ferramenta melhor para copiar puramente arquivos de uma unidade para outra.