Se bem entendi, você quer saber porque conexões USB não precisam de uma reinicialização e conexões seriais.
Isso pode ter mudado, mas se bem me lembro, as portas USB são sempre monitoradas, então se você adicionar algo, ele será automaticamente reconhecido. As portas seriais são verificadas apenas no momento da inicialização. Então, se não houver nada conectado, seu PC não tentará verificar essa porta novamente.