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Abra o Nautilus.
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Abra isto na barra de menu:
Editar → Preferências
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Selecione a guia "Comportamento".
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Selecione "Perguntar a cada vez" em "Arquivos de texto executáveis".
- Feche a janela.
Agora você pode clicar duas vezes no seu arquivo de texto executável no Nautilus para ser perguntado se deseja executar ou editar seu script.
Crédito da resposta: Nur