Você ainda pode filtrar usando mountpoint (se disponível no seu sistema):
for a in /*; do mountpoint -q -- "$a" || du -s -h -x "$a"; done
Se mountpoint não estiver disponível, mas stat for (enquanto stat ainda não for POSIX, pode ser mais comum), você terá que comparar a stat manualmente:
rootdevice="$(stat -c %D /)"
for a in /*; do [ "$rootdevice" = "$(stat -c %D -- "$a")" ] && du -s -h -x "$a"; done