Primeiro, pensei que o YUMI extraia os arquivos para o disco rígido, mas esse não é o caso. Meu entendimento agora é que o YUMI pode armazenar no pen-drive:
- O ISO como está ou
- Os arquivos extraídos do ISO como um sistema de arquivos dentro de uma partição
Esta é a razão pela qual para inicializar os arquivos extraídos ele pode usar o Syslinux, mas precisa do GRUB para inicializar a partir do ISO.
Acredito que a ideia aqui é melhorar o desempenho evitando a sobrecarga causada por usando o sistema de arquivos ISO. Aparentemente, o sistema de arquivos usado para os arquivos extraídos é mais eficiente do que o construído na ISO, que é depois de tudo de um CD.
Também há provavelmente uma sobrecarga adicional envolvida em ter um acesso de dois níveis: disco USB para acessar o ISO e, em seguida, acessar o sistema de arquivos ISO. Isso pode envolver sobrecarga de tipo de virtualização pelo GRUB para fazer com que o Linux acredite que o ISO é, na verdade, um CD.
Eu não tenho informações sobre o desempenho relativo de ambas as arquiteturas, extraído versus ISO, e a melhoria (se houver) provavelmente depende muito do tipo de trabalho que você faz.