A maioria dos aplicativos especificou configurações de entrada e saída. Eu acredito que o Skype tem a opção de alterar a configuração por meio de suas Ferramentas > Menu de opções. Aqui você pode alterar a entrada e saída do Skype como um aplicativo usando o menu suspenso para selecionar entrada e saída, seu fone de ouvido e microfone no fone de ouvido. Para tornar o restante dos sons do computador, especificamente sua música, reproduzidos pelos alto-falantes, basta definir os dispositivos padrão nas configurações de áudio do seu PC para serem os alto-falantes de saída. Isso pode ser encontrado no painel de controle Hardware e som > Som > Reprodução > em seguida, escolha os alto-falantes que você deseja que a música reproduza.