Se você alterar a letra da unidade uma vez, o Windows deve lembrar disso.
Você também deve tentar descobrir o que causa as BSODs. Eu duvido que seja TrueCrypt sozinho, já que ele roda em milhares de PCs sem quebrá-los.
Então, talvez faça uma captura de tela e poste isso aqui. Podemos ser capazes de apontar você na direção certa.
Além disso, esta postagem do blog pode ajudar também. Ou o Google para "truecrypt bsod".