O tamanho da pasta WinSxS é enganoso. A maior parte de seu conteúdo contém links físicos para outros locais. Hard-links são como atalhos, mas em um nível inferior, de modo que excluir o link também exclua o original e o link mostre no Windows Explorer como usar o tamanho do arquivo inteiro, mesmo que ele ocupe ainda menos espaço do que um atalho normal.
Assim, a pasta não é realmente usada em qualquer lugar próximo a 16 GB.