Encontrei o que acredito ser uma solução ideal para esse problema. O Smallpdf.com fornece um serviço de conversão PPT para PDF gratuito e funciona muito bem para preservar tanto a formatação quanto os hiperlinks.
Às vezes, pode atrapalhar a formatação de gráficos incorporados, mas há uma solução fácil. Apenas "Salvar imagem como ..." para criar um PNG a partir do gráfico, exclua o gráfico e insira o PNG. Smallpdf trabalha para PPT e PPTX, mas não para PPTM. Se você tiver um PPTM, salve-o como um PPTX antes de convertê-lo. Observe que o serviço gratuito está limitado a duas conversões por hora.
O fluxo de trabalho do Keynote também funciona, mas, como outros notaram, ele tende a mudar a forma como os slides são formatados.
Espero que os outros achem isso tão útil quanto eu!