Quando você tiver executado:
sudo make install
os arquivos necessários são copiados em locais relevantes nos diretórios do sistema. Pode colocar coisas em /usr/local , pode estar em /opt , pode ser distribuído através de outros diretórios relevantes no sistema. Eu me deparei com nenhum pacote que mantém e executa a partir desse diretório. Deve haver um arquivo README (ou similar) que deve fornecer uma visão clara do que será feito.
Assim, você pode remover o diretório de origem com segurança, mas pode haver um arquivo uninstall que faça exatamente o oposto de install , ou seja, ele removerá todos os arquivos copiados, para verificar se você tem isso. Se presente, melhor manter isso.
Como estamos fazendo isso, você deve usar checkinstall em vez de make install como checkinstall faz um arquivo .deb dos arquivos relevantes a serem copiados e você pode gerenciá-lo depois apenas usando qualquer gerenciador de pacotes por exemplo apt-get , aptitude ou do nível inferior usando dpkg . Você pode instalar checkinstall por:
sudo apt-get install checkinstall
Em seguida, verifique man checkinstall .