Com a edição do Skype Business parece haver um foco na integração com PBX e administração centralizada para um gerente de escritório, mas a lista completa de recursos ainda não está clara (e parece não haver nada de útil no site do Skype) :
Diferença entre o Skype para casa e para empresas?
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Também notei que as perguntas necessárias para o download do Skype não eram necessárias na versão comercial, mas isso acabou mudando e agora ambas as versões exigem que o usuário forneça informações pessoais antes do download.