Eu não sei sobre o Prism ou aplicativos da web, mas para aplicativos normais do OS X, há as preferências de atalhos de teclado:
Vocêtambémpodemodificaralistadepropriedadesquearmazenaosatalhosdiretamentecomalgocomo:
defaultswritecom.apple.mailNSUserKeyEquivalents-dict-add"New Message" "@Y"