Eu tenho o acrobat reader pro (windows) v8, mas uma pesquisa rápida no google indica que o padrão de leitura também pode incluir a ferramenta "texto de retoque". Na minha instalação, está no menu de ferramentas em "avançado". A ferramenta permite selecionar texto, escolher "propriedades" e escolher um novo tipo de letra. No documento que experimentei, cada seção do texto era uma caixa de layout separada e não consegui selecionar todas e alterá-las globalmente. Pode ser possível, mas eu não fui mais longe.
Eu também encontrei este link:
link
Que pode fornecer algumas informações úteis. A pessoa localizou vários locais em que o acroread estava verificando fontes. Além disso, se você puder descobrir qual é o nome da fonte que o Acrobat está procurando, você pode criar um alias.
> I managed that by creating
> ~/.fonts.conf file with the following
> content.
>
> *** <fontconfig> <alias binding="same">
> <family>Helvetica</family> <prefer>
> <family>Arial</family> </prefer>
> </alias> </fontconfig>
> ***